Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Colec12Q8K4Q8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Colec12Q8K4Q8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms