Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh16f2Q8K3M1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms