Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MyripQ8K3I4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms