Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Brd3Q8K2F0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Brd3Q8K2F0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms