Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms