Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nek9Q8K1R7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Nek9Q8K1R7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nek9Q8K1R7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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