Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Cldn34c1Q8K193 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c1Q8K193 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Cldn34c1Q8K193 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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