Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrit1Q8K099 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms