Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syn3Q8JZP2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syn3Q8JZP2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syn3Q8JZP2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms