Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CopaQ8CIE6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CopaQ8CIE6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms