Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nupl2Q8CIC2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms