Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms