Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brf1Q8CFK2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Brf1Q8CFK2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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