Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms