Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE96

Trmt6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt6Q8CE96 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt6Q8CE96 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trmt6Q8CE96 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms