Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms