Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ufl1Q8CCJ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ufl1Q8CCJ3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms