Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip1Q8CBD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms