Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg4aQ8C9S8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atg4aQ8C9S8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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