Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spef2Q8C9J3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spef2Q8C9J3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms