Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc159Q8C963 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms