Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe22Q8C6A8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe22Q8C6A8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms