Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms