Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfrp1Q8C4U3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms