Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgif2Q8C0Y1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tgif2Q8C0Y1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tgif2Q8C0Y1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms