Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TnrQ8BYI9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TnrQ8BYI9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms