Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsfm13Q8BXS2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms