Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrtm1Q8BXQ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms