Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp5Q8BX09 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rbbp5Q8BX09 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms