Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PcgF3Q8BTQ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcgF3Q8BTQ0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms