Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bicd1Q8BR07 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bicd1Q8BR07 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms