Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Efemp1Q8BPB5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms