Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gga3Q8BMI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gga3Q8BMI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms