Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tarsl2Q8BLY2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tarsl2Q8BLY2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms