Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zcchc4Q8BKW4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zcchc4Q8BKW4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms