Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms