Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Usp1Q8BJQ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Usp1Q8BJQ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp1Q8BJQ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp1Q8BJQ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Usp1Q8BJQ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Usp1Q8BJQ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Usp1Q8BJQ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp1Q8BJQ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp1Q8BJQ2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp1Q8BJQ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms