Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rufy1Q8BIJ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rufy1Q8BIJ7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms