Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Timm29Q8BGX2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Timm29Q8BGX2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms