Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms