Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sv2bQ8BG39 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms