Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Jmjd4Q8BFT6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms