Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prima1Q810F0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prima1Q810F0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prima1Q810F0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms