Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cracr2bQ80ZJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms