Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Amigo1Q80ZD8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms