Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TnnQ80Z71 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TnnQ80Z71 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms