Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm5bQ80Y84 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm5bQ80Y84 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5bQ80Y84 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5bQ80Y84 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm5bQ80Y84 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms