Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc28Q80XJ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Ttc28Q80XJ3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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