Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hapln4Q80WM4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms