Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep170bQ80U49 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms